ABSTRAK
Ekspresi GATA3 telah terbukti mempengaruhi kapasitas inisiasi tumor dari sel-sel induk/progenitor luminal tetapi tidak terdapat pada sel basal, sehingga menunjukkan peran penting GATA3 dalam mengatur diferensiasi sel progenitor luminal baik pada jaringan payudara normal atau ganas. GATA3 biasanya koekspresi dengan target langsungnya, yaitu reseptor estrogen (RE) dan beroperasi dalam lingkaran lintas regulasi positif. Pada penelitian ini, telah dilakukan analisis sifat fisikokimia, prediksi struktur sekunder dan struktur tersier protein GATA3 menggunakan beberapa macam sarana bioinformasi. Analisis sifat fisikokimia protein GATA3 dilakukan menggunakan server Expasy Protparam dan prediksi struktur sekunder dilakukan menggunakan Sopma dan Psipred. Dalam memprediksi struktur tersier GATA3, digunakan pemodelan homologi menggunakan perangkat lunak Modeller dan menghasilkan lima prediksi model struktur tersier GATA3. Akurasi hasil prediksi struktur kemudian dievaluasi menggunakan analisis plot Ramchandran dan dari kelima prediksi struktur, model yang terbaik adalah Model 2 dengan persentase 90,2 %.
Kata kunci: GATA3, sifat fisikokimia, struktur sekunder, homologi modeling, plot Ramachandran.
|