ABSTRAK
Protein Reseptor Orphan Reseptor-1 (ROR-1) adalah protein transmembran yang terdiri dari 937 residu asam amino yang terletak pada kromosom 1p31.3. ROR-1 memiliki peran dalam leukemogenesis dari sel CLL. Ko-ekspresi dari ROR-1 dan TCL meningkatkan leukemogenensis sehingga terjadi fosforilasi AKT, proliferasi sel dan resisten terhadap apoptosis. Penelitian ini, telah dilakukan analisis sifat fisikokimia, prediksi struktur sekunder dan struktur tersier protein ROR-1 menggunakan beberapa macam sarana bioinformasi. Analisis sifat fisikokimia protein ROR-1 dilakukan menggunakan server Expasy Protparam dan prediksi struktur sekunder dilakukan menggunakan Sopma dan Psipred. Dalam memprediksi struktur tersier ROR-1, digunakan pemodelan homologi menggunakan software Modeller 9.19 dan menghasilkan lima prediksi model struktur tersier protein ROR-1. Akurasi hasil prediksi struktur kemudian dievaluasi menggunakan analisis plot Ramchandran dan dari kelima prediksi struktur, model yang terbaik adalah Model 3 dengan persentase 82,0%.
Kata Kunci: ROR-1, Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL), Pemodelan homologi, plot Ramachandran
|